L'histoire de PP Møbler commence vers 1945, dans la petite ville de Vejen dans le Jutland, où deux frères, Ejnar et Lars Peder Pedersen, finissent leurs études d’ébénistes auprès du maître artisan Søren Villadsen.

Peu de temps après, en 1948, Ejnar et le fils de Søren Villadsen, Knud, ouvrent ensemble un atelier à Rungsted, puis plus tard à Allerød. Cette coopération ne dure que cinq ans, mais pendant cette brève période Ejnar Peder Pedersen fait la connaissance de Jørgen et Nanna Ditzel ainsi que de Gunnar Aagaard Andersen et l'atelier travaille sur une série de projets expérimentaux avec différents artistes et designers. Par conséquent, Ejnar se constitue un solide réseau, et lorsque l'atelier ferme en 1953, il propose à son frère de monter leur propre atelier.
Le 2 avril 1953, Ejnar et Lars Peder Pedersen entament la construction d'un atelier de 150 m2. Aujourd’hui encore, l'entreprise est toujours à la même adresse, mais l'atelier s’étend désormais sur plus de 1 800 m2.

La mise en place d'un atelier est un travail difficile, et les deux frères ne tardent pas à le découvrir. La journée, ils travaillent sur la construction de l'atelier et le soir ils fabriquent des meubles dans un atelier qui leur est prêté. Au début, ce sont particulièrement les conceptions d’Ejnar qui sont produites. Mais en peu de temps les commandes commencent à arriver. Les premiers clients sont Bovirke (qui vend des meubles conçus par Finn Juhl), le magasin de mobilier William Watting et A.P Stolen, dont PP Møbler produit le cadre inférieur du fauteuil n° 19 de Hans J. Wegner, le fameux Teddy Bear.
Dès 1955, PP Møbler aborde les aspects les plus expérimentaux de l'ébénisterie et cherche à repousser les limites du travail du bois, ce qui reste une caractéristique de l'atelier depuis toujours. Avec l'artiste Gunnar Aagaard, quelques prototypes très intéressants sont développés. C'est le début d'un important travail de développement avec des designers et des artistes qui ont marqué l'histoire du design danois.
En 1956, PP Møbler s'étend pour la première fois avec l'ajout d'un atelier de 150 m2. L'année suivante, le premier ouvrier, Ove Metysia, termine son apprentissage à l'atelier, recevant une médaille d'argent pour son projet final.
À la fin des années 50, PP Møbler est considéré et reconnu au Danemark comme un atelier sérieux et novateur. C’est à ce moment-là que commence la collaboration avec l'architecte danois, Hans J. Wegner. Ensemble, ils développent le prototype de l'Ox-chair, qui est aujourd'hui fabriquée par Erik Jørgensen Møbelfabrik.
Les années suivantes, de 1962 à 1968, ils créent de nombreux prototypes passionnants, qui entrent en production dans d'autres ateliers et usines, principalement chez Getama et Johannes Jensen.
Après des années de coopération fructueuse, Hans J. Wegner édite sa première chaise pour PP Møbler, la PP 203, qui est lancée en mai 1969. Une raison importante de la reconnaissance de Hans J. Wegner est l'intransigeance de PP Møbler en matière de qualité et de matériaux. Une anecdote raconte que Hans Wegner n'était pas trop préoccupé par la finition de la partie inférieure de la structure du Teddy Bear, puisqu’elle devait être recouverte par un tapissier garnisseur. Ejnar Peder Pedersen répond alors que tous les corps de métier doivent trouver de la fierté dans leur travail, et que la société ne mettrait jamais de l’artisanat de second ordre sur le marché !
Poursuivant sa coopération avec Wegner, PP Møbler entreprend une nouvelle période d'expansion au début des années 70. Il s'agit de la quatrième extension - la deuxième a eu lieu en 1965, avec 400 m2 ajoutés à l'atelier des machines, et la troisième en 1969. En 1972, la société étend l'atelier en rajoutant 400 m2, de sorte que tous les bâtiments soient reliés et que toute l’entreprise soit sous un même toit.  
1972 est une année bien remplie. L'atelier prend en charge plusieurs modèles de Hans Wegner venant de l’atelier Andreas Tuck, et la production de l'entreprise ne cesse d’augmenter avec l’arrivée d’un commercial à temps plein, Gerhard Olsen.
En 1974, PP Møbler commence à exporter ses meubles sur le marché japonais. Le commerce débute avec une chaîne japonaise de magasins de meubles dont Hans Kristensen, qui deviendra plus tard un vendeur pour PP Møbler sur le marché japonais, est le gestionnaire. Aujourd'hui, le Japon demeure l'un des marchés d’exportation les plus importants pour PP Møbler. La raison en est la longue tradition du pays pour les arts décoratifs et l'artisanat avec un souci particulier du détail et de la perfection, comme chez PP Møbler.

Dans la seconde moitié des années 70, PP Møbler se positionne sur le marché du meuble comme l'un des acteurs les plus importants en termes de design et de qualité. Plusieurs nouveaux modèles de Hans Wegner sont créés et les premiers grands projets d’architecture intérieure commencent à voir le jour. Ainsi, PP Møbler, coopérant avec Poul Kjærholm, édite les chaises de la salle de concert du musée d’Art moderne de Louisiane. C’est à la fois un défi d’expression visuelle, mais aussi d’innovation technique, qui exige de travailler le bois en tant que matériau acoustique. La salle de concert, qui a aujourd’hui encore ses chaises originales, témoigne de la capacité de PP Møbler à fabriquer des meubles avec une durée de vie aussi longue que le matériau lui-même. La même année, PP Møbler coopère avec le décorateur d'intérieur Niels Fagerholt sur une exposition, Mesters Møbler, au Statens Kunstfond.
Dans le même temps, la deuxième génération entre dans l'entreprise familiale : Søren Holst Pedersen a terminé son apprentissage d'ébéniste chez Virum Møbelsnedkeri en 1969, mais continue ses études et obtient un diplôme de technicien du bois au Dansk Teknologisk Institut. Néanmoins, il ne travaille pas immédiatement pour PP Møbler, mais choisit de travailler à Silkeborg pour la Dansk Spånplade Komlpagnis Laboratorium. Il y reste cinq ans, et en 1977, il intègre PP Møbler en tant que directeur de production.
Cette même année, Lars Peder Pedersen choisit de se retirer de la gestion de l’entreprise afin de se concentrer sur la création. Son frère Ejnar reste alors unique gérant jusqu'au changement de génération en 1998. Pendant cette période, l'atelier est honoré par une série de récompenses : le Møbelfabrikantforeningens Furniture Award en 1980, le Bruno Mathsson Award en 1996, et le Nationalbankens Honorific Award en 1998.

Durant les années 80, Hans J. Wegner continue à concevoir de nouveaux modèles pour PP Møbler. Le point culminant du design et de la fabrication est atteint avec la Circle Chair, qui transgresse les limites formelles et technologiques du métier. Mais la décennie comportera également de nombreux travaux d’architecture intérieure pour différentes institutions. Une grande quantité des chaises de Hans Wegner sont livrées aux Ferries DSB en 1981, et à Holstebro Town Hall. Des intérieurs minimalistes et organiques sont créés en collaboration avec Dahl et Lindhardsen en 1986, et en 1988 le siège de la société Baltica est meublé avec des PP 58 de Hans Wegner.
Comme les exigences artisanales et technologiques de la Circle Chair l’indiquent, PP Møbler est plus que jamais axé sur l'innovation. Cela est en parti dû au retour de Søren qui avait quitté l’atelier pour être directeur de production chez Fritz Hansen Møbelfabrik de 1982 à 1987.

Au début des années 80, Søren coopère avec le Dansk Teknologisk Institut sur une nouvelle technique appelée précompression, qui est mise en œuvre avec succès lorsque PP Møbler commence la production de la chaise PK 15 de Poul Kjærholms. Le retour de Søren signale également le début d'un changement de génération à PP Møbler.
Dans les années 90, de nombreux nouveaux modèles sont créés pour PP Møbler. Beaucoup sont de Wegner, mais d'autres designers internationalement reconnus viennent aussi apporter leur passionnante contribution. C’est chez PP Møbler que le prototype de la fameuse Trinidad Chair de Nanna Ditzels est développé. De même, le curieux VIPP de Verner Pantons entre en production, et une coopération avec le professeur Vilhelm Wohlert débute. La décennie contient également de nombreux projets d’intérieur à grande échelle, tant au niveau national qu’international. Le Churchill College en Angleterre est meublé de chaises de Hans Wegner, ainsi que le musée Sagawa au Japon, et plusieurs ministères dans le Folketinget.
Les années 90 représentent également la décennie où Hans J. Wegner est célébré lors d'une exposition spéciale au Dansk Arkitektur Centerin,  en 1991. Cette exposition devient d’ailleurs dans les années suivantes un événement mondial et fait le tour du monde, d’Okinawa au Japon à Toronto au Canada en passant par la Suisse, pour finir à Tønder, ville natale de Hans Wegner.
À la fin de la décennie, PP Møbler commence sa coopération avec Søren Ulrik Petersen, qui jusqu'ici a créé plusieurs nouveaux modèles de meubles pour la collection. En 2003, à l'occasion du 50e anniversaire de PP Møbler, le Dansk Design Center présente l’exposition « Ekspperiments » consacrée aux prototypes de PP Møbler.